除通過激光可以去除色素痣外，還可以通過手術切除的辦法將痣切除。2mm直徑以下的色素痣可以採用激光點痣的方法，通過激光燒灼色素痣使其汽化，色素痣去除後創面可以自行癒合，且與周圍皮膚長平，術後不會留下明顯痕跡，此是激光點痣的優勢，但並不是所有的色素痣都可以利用激光去除。

對於直徑超過2mm的色素痣如果用激光去除，則不能完全去除乾淨，並且會留下不美觀的火山口樣坑狀痕跡，所以較大的色素痣可以通過手術切除，通常在局部麻醉下可以進行手術。切除色素痣後將兩側皮膚拉攏、對合，用整形外科的方法和縫線進行縫合，最終僅留下一條線狀，且與皮膚顏色相近的痕跡。