小腸疾病的主要檢查方法，包括以下方面：

1、小腸CT：檢查需服用瀉藥如聚乙二醇，大量飲用後聚集在小腸內，此時行CT檢查包括影像重建，有助於明確小腸壁有無增厚、強化情況，及腸壁外腸繫膜有無增粗、迂曲以及脂肪改變。對於診斷小腸疾病如克羅恩病，鑑別診斷腸結核淋巴瘤等均有一定幫助；

2、膠囊內鏡：小膠囊相當於數碼相機，口服後隨腸道蠕動進行實時拍照，對腸道內黏膜病變、佔位性病變，均具有較好診斷價值。如果患者存在腸梗阻表現，或懷疑存在腸梗阻時應儘量避免使用，因為膠囊內鏡可能在狹窄部位無法通過，導致膠囊滯留；

3、小腸鏡：經口進鏡時主要檢查空腸、迴腸上段，而經肛進鏡時通常檢查迴腸中下段，理想狀態是小腸鏡能夠兩邊貫通，完成整個小腸的檢查。但實際工作中比較困難，因為小腸長度為5-7m，無論從經口、經肛均無法100%達到對接。因此，小腸鏡需要在有經驗的大夫，且有經驗的醫院進行，但也存在部分患者檢查不全面情況。