牙齦口腔潰瘍可以使用促進癒合類的藥物，包括複方呋喃西林糊劑、潰瘍散、重組人表皮生長因子凝膠或者是外用溶液；也可以使用噴霧劑類的藥物，例如開喉劍噴霧劑或者西瓜霜噴霧劑等。

牙齦潰瘍通常不是一個好發的部位，所以建議檢查是否由於尖銳的牙尖，或者出現不良修復體所壓迫產生口腔潰瘍，如果是不良修復體，建議去除或者重新修復。

另外，要維護好口腔內衛生，可以使用漱口水進行含漱，例如複方替硝唑漱口水。同時做好自我菌斑的控制，做好齲病和牙周病及時的治療，這樣才能維護口腔健康，口腔黏膜疾病才能不再發生，可以提高機體抵抗力，也可以服用藥物，例如轉移因子、匹多莫德等。