口腔潰瘍好了又反覆發作，有可能是由於機體抵抗力低下引起的，可以吃營養性比較高的食物，也可以補充維生素和微量元素，能夠促進營養的吸收。另外，需要調節機體的抵抗力，可以服用免疫抑制劑，例如左旋咪唑、匹多莫德、轉移因子等。需要有充足的睡眠和精神狀態，保證精神壓力不要太大。

在潰瘍發作時，要積極的促進癒合，使用促進癒合的藥物，例如潰瘍散、地塞米松的潰瘍貼膜。如果反覆發作，也可以觀察口內是否有尖銳的牙尖、殘根、殘冠或者口腔是否牙周條件較差，可以積極的治療口腔內的疾病，避免口腔潰瘍再次復發。