腸道功能紊亂症狀較多，如腹脹、噯氣、腹瀉、腹痛，這些症狀均與功能性紊亂息息相關。患者出現上述症狀後，需檢查胃腸的情況，如做胃鏡檢查或做腸鏡檢。若未發現相關疾病問題，醫生一般會考慮為腸道功能紊亂。

在治療上以調節腸道菌群，調節患者情緒為主。服用益生菌調節腸道菌群，情緒焦慮或抑鬱的情況可服用鎮靜藥物或消氣藥物，可減少患者功能性紊亂症狀。