腸鏡檢查是一項成熟的內鏡檢查方法，對身體沒有危害。但是，腸鏡畢竟屬於一種有創檢查，檢查過程中會對腸道黏膜造成一定損傷，一般在2-3天可以完全恢復正常。但是有禁忌症的患者，建議做腸鏡時要慎重。如果患者有心肺功能不全、急性腹瀉等患者，在做腸鏡時需要慎重考慮。

腸鏡屬於有創檢查，存在一定的風險，比如患者服用瀉藥進行腸道清潔時，可能導致水電解質平衡紊亂。如果患者腸道有病變，可能出現腸梗阻、出血、穿孔等併發症。因此腸鏡檢查應掌握適應症和禁忌症，合理進行選擇。