小腸多發潰瘍的病因如下：

1、感染性疾病：常見細菌感染，通過使用抗生素一般可以緩解潰瘍，有時候可能不是特別常見的細菌，比如艱難梭菌等。結核桿菌感染時全消化道均可被累及；

2、炎症性腸病：在臨床最近幾年比較多見的是克羅恩病，克羅恩病也可以累及全消化道，治療比較困難；

3、缺血性疾病：老年患者伴有糖尿病，血液呈高凝狀態時可以由於缺血導致小腸多發潰瘍；

4、腫瘤性疾病：比如小腸腫瘤、淋巴瘤，可導致小腸多發潰瘍；

5、藥物因素：比如應用非甾體抗炎藥，可導致小腸多發潰瘍。