肝囊腫是良性囊腫，可伴隨小兒一生，大多無不良影響。一種情況為偶然發現，患兒體檢篩查提示肝囊腫，無其他不適。可進一步做肝功能檢查，如肝功能正常，無繼發症狀，不用處理，可繼續觀察。另一種情況為症狀性囊腫。患兒反覆發生腹痛、發燒、黃疸，化驗檢查發現肝功能異常，提示已發生肝細胞損害。如不及時治療，可發展成肝硬化、膽道系統結石。此類患者應及時入院治療。