兒童打完手足口疫苗後的發熱多為低熱，經過2-3天即可好轉，在此期間需注意多休息，儘量保持房間安靜，溫溼度適宜，勤開窗通風，以保持空氣清潔，同時可採取物理降溫幫助退熱，如用毛巾溼冷敷額頭，溫水擦拭身體，在額頭、喉、後頸部貼退熱貼，患兒睡覺時露出手腳等，以起到散熱作用。如果發現患兒體溫高於38.5℃，需適當服用退熱藥，如體溫持續增高或不下降，需積極就診治療。

通常小兒打完手足口疫苗後有發熱，可能影響到食慾，甚至出現噁心、嘔吐症狀，期間應注意多補充水分，不僅可提高身體免疫力，還可補充發燒丟失的水分。此外，部分患兒發熱期間口中無味，可能喝不下溫開水，家長可以給寶寶喝一些蔬菜汁或者水果汁，給予清淡、易消化的食物，如各種蔬菜、水果、米粥等。此外，不可讓小兒進食過多油炸、甜膩、辛辣食物，以防止胃腸道負擔加重而導致身體康復速度下降。