結膜炎是眼科常見疾病，致病因素多樣，需要根據不同的致病原因，應用不同的藥物進行對症治療。
　　結膜表面大部分暴露於外界，易受外界環境刺激和損傷，且結膜囊內有適宜的溫度與溼度，易受病原微生物感染。結膜炎的治療原則是去除病因，控制炎症，阻止其蔓延擴散。結膜炎感染的病原體主要包括有以下幾種，分別是細菌性、病毒性、衣原體性。而免疫性結膜炎也不少見。針對細菌性結膜炎：主要是局部應用消炎眼藥水，常用的有喹諾酮類和氨基甙類眼藥水，如果症狀嚴重，必要時全身應用抗生素治療，同時做好消毒隔離工作，預防傳染。病毒性結膜炎：主要是局部應用阿昔洛韋、更昔洛韋、干擾素等抗病毒眼藥水，必要時可應用激素類眼藥水，也要做好消毒隔離工作，預防傳染。衣原體性結膜炎：主要是局部應用利福平、磺胺類眼藥，嚴重者可全身應用多四環素、紅黴素。免疫性結膜炎：主要是局部應用抗過敏或激素類眼藥水，必要時可局部應用免疫抑制劑。
　　因此結膜炎沒有最好的眼藥水，只有有效對症的眼藥水。