棘阿米巴性角膜炎，主要是由於棘阿米巴原蟲感染角膜導致。它的原因主要是角膜接觸到棘阿米巴汙染的水源，特別是角膜接觸鏡或清洗角膜接觸鏡的藥液汙染導致感染。

診斷上，可做病灶區的刮片培養，培養出棘阿米巴原蟲，就診斷為棘阿米巴角膜炎。治療上，可進行病灶的局部切除或使用抗阿米巴的藥物，包括阿米唑類的藥物。棘阿米巴性角膜炎相對比較兇險，預後不良，重者需做角膜穿透性移植，所以此病以預防為主。