角膜炎的治療根據病因、病理生理機制、病變嚴重程度而異。
　　細菌性的角膜炎一般予以局部點滴抗生素眼藥水或眼藥膏，比如左氧氟沙星、妥布黴素眼藥水等，注意局部衛生，規律點藥。病毒性的角膜炎一般予以局部點滴抗病毒的藥水，比如利巴韋林、更昔洛韋眼用凝膠，阿昔洛韋眼藥水等，角膜基質水腫的可用低濃度的糖皮質激素滴眼液。真菌性的角膜炎，一般局部點滴兩性黴素眼藥水、氟康唑眼藥水或那他黴素眼藥水，也可以用碘酊燒灼，必要時口服伊曲康唑等抗真菌藥。如果患者沒有及時到達醫院進行診治，延誤病情，病灶反覆發作遷延不愈，特別容易引起角膜瘢痕的形成，影響視力的角膜瘢痕需要後期進行角膜移植。倘若炎症得不到有效控制會出現前房反應、瞳孔粘連、角膜穿孔或眼內炎，甚至需要進行眼球摘除手術的。
　　角膜炎還可以是局部免疫反應引起的，可以用低濃度的糖皮質激素滴眼液聯合角膜保護藥物治療。
　　綜上所述，角膜炎可以由病毒、細菌、真菌等感染引起，也可以是免疫反應，治療則應根據病因不同而異。