大部分胃息肉無需在內鏡下予以手術切除，但是也不能一概而論。在臨床上胃息肉有胃底腺息肉、增生性息肉，以及腺瘤樣息肉，對於前兩者，若直徑在2cm以下，通常不做內鏡下切除手術。但是術前通過取病理，或者通過電子放大胃鏡等方法，發現息肉其實是胃腺瘤樣息肉，在原則上治療策略與腸息肉相同。

若有腺瘤樣息肉，建議儘早在內鏡下進行切除手術。但並非所有病人，均要遵循息肉在2cm以下，不予以內鏡切除手術的原則，在治療上還需遵循胃鏡醫生的臨床經驗。若通過行胃鏡檢查後發現，部分胃息肉在內鏡下形態欠佳，或者行電子放大胃鏡後，懷疑胃息肉不是普通胃息肉時，也無需拘泥於息肉大小或息肉的術前病理類型。只要臨床高度懷疑可能有其他異常，如息肉表面腺管，高度懷疑合併有早癌，則可以在內鏡下行切除手術。