腳部長蹠疣首先強調患者到醫院就診，醫生會做冷凍。冷凍是治療蹠疣最常見的方法，冷凍以後比較疼，走路起來也不方便，幾天以後可能恢復，但有些人蹠疣由於比較深，可能一次冷凍無法治癒，要多次進行冷凍。

有些人蹠疣很頑固，通過冷凍方法不一定能夠治療，可以通過激光、電灼等其它物理方法結合在一起。更加頑固的話，可以局部注射一些抗病毒藥物，比如局部注射干擾素。還有一些新的方法也可以用於蹠疣治療，比如中草藥，可以通過敷，將蹠疣逐漸腐蝕，再配合小刀局部護理將壞死組織清除，再敷中草藥。

還可以用光動力治療，把角質層削除，然後露出點狀出血狀態，再應用光敏劑進行光動力治療，效果較好。總之，蹠疣治療是一個比較痛苦的過程，無論哪種方法，治療期間患者走路都不方便，所以一定要及時治療。