寶寶出現喉嚨皰疹，主要原因是病毒感染，傳播途徑通常包括呼吸道傳播、接觸傳播，比如接觸到有皰疹的寶寶口水，則具有一定傳染性。病毒通常包括腸道病毒、柯薩奇病毒，以及部分皰疹病毒。如果寶寶僅單純喉嚨、咽後壁有皰疹，稱為皰疹性咽炎。除喉嚨出現皰疹外，如果同時手、腳或者肛周出現皰疹，則稱為手足口病。

病毒感染類疾病的寶寶除喉嚨有皰疹外，較多寶寶伴隨發熱症狀，出現發熱症狀時要進行降溫對症處理，緩解寶寶症狀。如果寶寶低燒時，精神狀態較好，可以先物理降溫或者觀察。如果寶寶出現高熱，可以選用布洛芬或者對乙酰氨基酚進行藥物降溫。使用布洛芬或者對乙酰氨基酚時，24小時內每個藥使用避免超過4次，在1次發熱病程中儘量選用同種退燒藥，不到迫不得已不要布洛芬和對乙酰氨基酚交替使用，以免增加藥物副作用。