皰疹性咽喉炎的治療與病因相關，具體如下：
1、A組柯薩奇病毒引起，以抗病毒為主；
2、合併中耳炎、鼻竇炎，加用抗生素，控制感染；
3、伴有高熱驚厥併發症，需進行抗驚厥處理；體溫超過38.5℃，應用退熱劑治療；
4、飲食以溫涼流質或半流質為主；
5、補充維生素類藥物；
6、應用中藥霧化噴霧或內服中藥，如敗醬草、山豆根等。