傳染性軟疣治療週期通常較長，並且需要3-6月才能進行觀察，檢查是否復發。如果發生了復發的情況，建議再次到醫院進行復診，而且患者應該進行徹底的治療。當然，會陰部的傳染性軟疣復發最常出現於治療後的3個月內，隨著時間的延長，患者傳染性會逐漸的降低，復發的可能性也會降低。患者經過治療後6個月通常如果不復發，即可達到臨床治癒的效果；如果治療後1年內不復發,以後復發的可能性就極小，傳染的可能性也會極小。因此，會陰部的傳染性軟疣治療後通常在第3個月是一道坎，在這期間患者要隨時去醫院進行檢測複診，合理用藥，通常不適宜盲目地換藥。