黏液表皮樣癌不是絕症，大概一半的病人都能治癒，從目前的隨訪和臨床觀察看，唾液腺的惡性腫瘤治癒率遠高於普通上皮來源的口腔癌。黏液表皮樣癌，從病理上看目前分為兩類，具體預後差別如下：

1、高分化黏液表皮樣癌：儘管為惡性腫瘤但更傾向於良性的生物學特徵，臨床上經常發現這類腫瘤包膜完整、有活動度，如果擴大切除的效果滿意，甚至不用術後放療也能長期生存；

2、低分化黏液表皮樣癌：高度惡性，生物學行為更強、浸潤性更強，有淋巴結轉移的可能，預後明顯較差，因此這類腫瘤，一般是手術結合頸淋巴結清掃術再結合術後放療，綜合治療後黏液表皮樣癌的預後有明顯的提高。