縱隔腫瘤手術目前已經非常完善。縱隔腫瘤分為上縱隔、中縱隔和下縱隔，也分為前縱隔、中縱隔和後縱隔。手術切除需判斷縱隔腫瘤的位置，前縱隔腫瘤可能採取前側切口或正中劈開胸口的手術切口。後縱隔或中縱隔腫瘤一般採取後側切口。手術的原則基本都是以完全切除腫瘤，最大限度地保護功能為手術目的。
隨著近10年來手術技術的發展，現在胸腔鏡技術已經廣泛地應用於縱隔腫瘤的切除。小於3cm或小於5cm的縱隔腫瘤，在條件允許的情況下，都會考慮做微創手術。微創手術的切口可能只有3-5cm左右，足夠進行縱隔腫瘤的切除。