膝蓋軟骨瘤唯一有效的治療方法是手術切除。以往考慮骨軟骨瘤隨著骺板閉合會停止生長，而且惡變率非常低，只有0.5%-1%左右，所以只有軟骨瘤出現疼痛，壓迫神經、血管，才有手術指徵。現在建議一旦確診骨軟骨瘤，還是把它切除，整個切除是比較有效的方法。切除後復發可能性不太大，但是不要劇烈運動，注意休息。另外，多發性骨軟骨瘤沒辦法一次切除，只能分次切除，先把累及關節活動或者壓迫神經、血管的瘤子切掉，其他的可以分成二期手術，三期手術切除。