軀體化精神障礙的治療一般包括心理治療和藥物治療。心理治療目的在於讓患者逐漸瞭解疾病的性質，改變錯誤觀念，解除或減輕精神因素的影響，使患者對身體情況與健康狀態有相對正確的評估，逐漸建立對軀體不適的合理性解釋。首先與患者建立良好關係，以耐心、同情、接納的態度對待患者的痛苦和敘述，理解患者軀體體驗的真實性，對檢查結果給予清楚的報告，並進行恰當解釋，對心理和社會因素做出恰當評估。

目前常用的心理治療包括認知行為治療、精神分析、森田療法等，同時，應用精神藥物進行對症治療也較為重要。由於患者症狀的多元性，常合併使用抗精神病藥物，對伴有焦慮、抑鬱的患者，可選用抗焦慮藥物及三環類SSRI、SNRI等抗抑鬱藥物治療，存在偏執傾向的患者可使用小劑量非典型抗精神病藥物治療。