自身免疫性肝炎的病因不清，故目前無治療的特效藥。

臨床上，治療自身免疫性肝炎的目的主要是緩解肝臟損傷，延緩或阻止向纖維化的進展。單獨應用糖皮質激素或聯合硫唑嘌呤治療是目前自身免疫性肝炎的標準治療方案。應根據患者的病情輕重在醫生指導下規範化治療。