耳膜即鼓膜，若鼓膜穿孔流膿是由於急性感染所導致，如急性化膿性中耳炎，患者通常需使用頭孢類、阿奇黴素類或喹諾酮類抗生素進行口服，同時局部使用雙氧水進行外耳道膿性分泌物的清理。患者還可使用抗生素滴耳液，如氧氟沙星滴耳液進行滴耳。若患者鼻塞明顯，可以應用鼻減充血劑，如麻黃素噴鼻，可以使鼻塞、咽鼓管黏膜充血腫脹好轉，從而減輕耳朵的壓力。通過綜合治療，在7-10天耳朵急性化膿性炎症通常會逐漸好轉、痊癒。

若患者鼓膜穿孔長期流膿，藥物治療效果不佳，通常需要進行耳內鏡及耳朵的CT檢查。若是由於膽脂瘤型中耳炎引起耳道長期慢性流膿，應採取手術治療。