賁門失弛緩症主要通過手術治療，把下段類似於括約肌的部分鬆開，鬆開後則沒有失弛緩。手術可以通過腔鏡，從腹腔鏡或胸腔鏡把相應部分切開，還可以經過食道，用消化道內鏡從黏膜下把下端的環形括約肌切開，從而達到緩解失弛緩的作用。賁門失弛緩手術前一定要明確診斷，辨別患兒出現嘔吐、厭食、吞嚥困難等現象的原因，排除其它疾病。診斷明確後，即可手術。