食管囊腫是發生在食管上的囊性包塊，是一種先天性的疾病。通常多發於食管上段。食管是一段長條形肌性管道，囊腫一般長在肌層當中，絕大部分與食管不相通，可能對周圍器官產生壓迫症狀，但這種情況比較少見。絕大多數食管囊腫並無症狀。新生兒及嬰幼兒如檢查發現食管囊腫，因囊腫黏膜組織會分泌一些液體，這些液體造成囊腫不斷長大，從而導致消化道黏膜異位，此時會發生出血或食道周圍的炎症。