複發性口腔潰瘍發生原因是多種因素綜合作用的結果，有明顯個體差異性。研究發現口腔潰瘍發生與遺傳因素、免疫因素、全身系統性疾病有關，如十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎患者發生口腔潰瘍幾率增大；環境因素如精神壓力大、心理緊張、營養缺乏、缺鐵、缺鋅、維生素B缺乏等均會導致口腔潰瘍發作；而女性經期由於各種激素水平變化也會易誘發口腔潰瘍。

患者發生口腔潰瘍後需對症處理，目前無有效去除口腔潰瘍方法，由於複發性口腔潰瘍特點為明顯複發性、自愈性。輕型口腔潰瘍以局部治療為主，如口腔潰瘍散、潰瘍貼以及噴霧劑等；重型口腔潰瘍患者可配合局部治療及全身用藥聯合方法。在護理得當情況下，複發性口腔潰瘍週期在10天左右，臨床症狀可得到有效控制。