Y染色體遺傳規律是兒子的一對性染色體XY染色體，分別從父母遺傳而來，Y染色體來自父親，X染色體來自母親。女兒的一對性染色體XX染色體分別從父母遺傳而來，其中一條X染色體來自父親，另一條X染色體來自於母親。

如果致病基因位於X染色體，則子代中兒女都有患病的可能。如果致病基因位於Y染色體，子代中只有兒子存在患病的可能。女兒因為性染色體中沒有Y染色體，所以沒有患病的可能。以上所述的致病基因位於性染色體，而位於性染色體的致病基因遺傳給下一代，稱為性染色體遺傳，也可稱為稱為伴性遺傳。如果致病基因位於X染色體稱為伴X染色體遺傳，致病基因位於Y染色體則稱為伴Y染色體遺傳。

致病基因位於Y染色體，該基因突變即可致病，且隨Y染色體的傳遞而傳遞，這種方式導致疾病稱為Y連鎖遺傳病。Y連鎖遺傳病的特點是疾病隨Y染色體的遺傳而傳遞，即男性傳遞給兒子，不傳遞給女兒。因Y染色體主要是男性性別決定基因，和精子發生相關因子有關的基因，其它基因很少，故Y連鎖遺傳病極為少見，主要包括無精子症，Y連鎖視網膜色素變性等。