飛秒激光輔助下的白內障摘除手術，主要的劣勢是如果患者有角膜疾病或者乾眼症狀，飛秒手術可能加重角膜上皮的損傷，以及術後乾眼以及術前乾眼症狀加重。如果患者角膜上皮或者眼表有明顯的疾病，飛秒激光以後，可能患者乾眼症狀，甚至眼表問題表現更加明顯。

所以術前檢查至關重要，術前如果患者有眼表疾患時，要在術前對眼表疾患進行治療和干預，可能對飛秒激光術後併發症以及術後劣勢，進行一定的減少和預防。飛秒激光輔助下的白內障摘除手術為目前先進的白內障摘除手術，主要利用飛秒進行手術預切口以及預撕囊以及預劈核的治療，為手術難度以及手術安全保障，提供強大的技術支持。