一般玻切手術後可發生白內障，所以玻璃體切割術中需給眼球內持續灌注液體，目的是儘量模仿眼淚的生理性狀，但一般無法完全模擬眼淚，灌注液持續存在可導致晶狀體營養代謝障礙。臨床進行玻璃體切割術後，可能1-3個月開始形成白內障，較晚在0.5-1年後也可形成白內障。

目前認為玻切手術後需將晶狀體摘除，避免白內障形成。此外，玻切手術將晶狀體摘除時需保留囊袋，而囊袋有時在玻切手術後會發生渾濁，稱為後囊性渾濁，也稱為後發性白內障。此時進行囊膜激光切開即可治癒，一般1-3分鐘內即可完成，患者不需要住院進行手術。因此，玻切手術時若患者沒有特別要求，一般會摘除晶狀體。