5歲男孩體檢要注意檢查以下項目：

1、身高、體重、頭圍的測量：5歲男孩進行體檢時要進行生長發育指標的測量，將上述指標標註在生長發育曲線上，與標準曲線做對照，若發現異常要早期指導並給予糾正；

2、全身體檢：要進行心、肺、腹，以及皮膚、黏膜的體檢，有助於早期發現問題，進行進一步的檢查；

3、外生殖器體檢：要注意是否有包皮過長、包莖，或者雙側睪丸下降等情況。如果孩子有包皮過長、包莖，要給予指導，否則容易繼發泌尿道感染，出現包皮發炎等，因此要及時給予治療；

4、血常規：要進行血常規的測定，觀察孩子是否有貧血、炎症，以及血小板的異常。如果發現異常，可以進行進一步的診斷和治療，重點在於早期發現血液方面的疾病。