若出現多器官系統功能的衰竭，治療的主要措施如下：

1、消除多器官功能衰竭引起的病因和誘因，積極治療原發病最為重要；

2、改善和維持組織的充分氧合；

3、保護肝臟、腎臟功能；

4、需要進行營養的支持和代謝調理；

5、若出現感染，要合理的應用抗菌素；

6、對於抗氧化劑應用，包括特異性的治療。

多器官功能衰竭的治療方法，若是呼吸系統出現器官衰竭，通常要保持氣道的通暢，給予吸氧，然後呼吸機的支持療法，防治肺水腫。循環系統的衰竭，通常要維持正常的循環功能，然後保證組織的血液灌注，恢復各器官功能的基礎。需要維持有效的循環血容量，應用一些血管的活性藥物，甚至於其它循環功能的支持療法。

肝臟方面治療，在恢復血容量的基礎上，保證肝臟的血液供應，要給予加強支持療法，包括供給維生素、補充熱量、補充新鮮的血漿、白蛋白，包括支鏈氨基酸促進肝臟的細胞合成，合成蛋白。腎臟方面通常會使用一些利尿劑，若是無尿，可能要採用血液透析的療法，避免應用有害於腎臟的藥物。血液系統方面，因為血小板和凝血因子的大幅度下降引起的出血，可以給予輸注濃縮血小板、新鮮冰凍血漿，甚至要補充部分纖維蛋白酶原。