懷孕同時得了角膜炎，需權衡用藥對胎兒健康的影響。正常情況下，懷孕並不影響角膜炎的治療，因為大部分的角膜炎是局部使用眼藥水進行治療，有些患者會擔心藥水通過淚點可能會進入喉嚨，被吞嚥吸收影響胎兒，但其實眼藥水的濃度較低，通過鼻淚管進入喉嚨的量也較少，還會再被機體吸收，通過循環到達胎兒處的量很少，基本可以忽略不計。若患者需全身用藥，則應權衡藥物對胎兒的影響，如是否會引起畸形以及其他併發症。

臨床中若角膜炎患者懷孕，醫生會告知患者選用藥物的安全性以及對胎兒的影響，儘量不選用全身用藥，局部點用藥水儘量選擇比較安全的藥物，有些藥物沒有影響，有些藥物可能會有一定風險，患者需慎重選擇。