機體感染病毒或者病菌的毒力不是特別強且抵抗力較好時，急性角膜炎有可能會自然恢復、好轉。但是恢復好轉也需要承擔風險，病變初期時症狀可能不嚴重，若未進行及時治療，會導致病變進一步加重，進而導致角膜病灶擴大，病變還會向角膜深層組織侵犯，增加再治療時的難度。

病變侵犯至深層組織時，即基質層時，預後也會存留瘢痕，瘢痕屬於永久性，不會自然恢復透明。因此，角膜炎處於急性期時，應及時去醫院就診，切勿使自己承擔風險，若病情加重延誤治療，則後果較差。