對於乙肝或丙肝引起的肝功能衰竭，即使肝功能逆轉，丙肝和乙肝病毒也很難清除，因此很難痊癒。但對於藥物或菌類引起的中毒性急性肝功能衰竭，如果肝功能能夠恢復，則患者可以得到痊癒。
丙肝或乙肝引起的急性肝功能衰竭患者，通過外科手術肝移植進行治療以後，患者肝功能可以恢復到完全正常的狀態。80%-90%的乙肝患者可以清除病毒，此類患者可以痊癒。丙型肝炎引起急性肝功能衰竭的患者移植後，可以通過服用抗丙肝藥物清除體內丙肝病毒，同樣也可以獲得痊癒。