小兒脊髓栓系綜合徵在一般情況下，體表症狀表現得非常明顯，患兒有脊髓脊膜膨出，有包塊、皮毛竇，還有皮贅以及一些皮膚小凹，通過體檢即可發現。

有一些隱性脊柱裂的患兒體表表現不是很明顯，主要通過一些其他症狀，如大小便，有便秘、小便失禁的症狀。

通過進一步檢查，可發現部分患兒會出現下肢運動、感覺障礙，嚴重的甚至會出現神經營養不良導致的皮膚潰瘍，這些都是小兒脊髓栓系的症狀。