脊髓損傷的後遺症比較多，輕度脊髓損傷的後遺症，臨床上可以忽略。但比較嚴重的脊髓損傷後遺症，包括運動、感覺、排便障礙等，還包括病理反射、肌張力異常、心理問題，這些後遺症要根據不同專科，用不同的方法進行處理。

常規處理後遺症先是物理治療，物理治療要保持全身各關節的活動度，把殘存的肌力即神經控制正常，訓練好沒有受到損傷的肌肉肢體力量，儘可能實現患者功能的完整。其它包括作業治療、康復科訓練，以及患者的日常活動，包括穿衣服、吃飯、處理大小便、坐輪椅、出行、乘車等基本生活技能。部分損傷節段較低的患者，若想恢復得較理想，要進行職業性訓練，讓脊髓損傷度過急性期後，能從事一定工作，有一定收入。