脊髓栓系手術成功所帶給患者的益處將遠遠大於不利之處。脊髓栓系手術很少會造成患者癱瘓，最大的風險是可能出現二便的障礙，因為脊髓栓系最容易影響二便。在進行鬆解的時候可能會把一些負責管理兩便的神經，在沒有區分的情況下截斷，進而就會導致兩便的完全功能障礙，而且不可恢復。當然隨著電視監測的應用，此種風險幾乎降得非常低。因為在決定切除認為是終絲的情況時，可以使用電刺激器，通過不斷的驗證確認，旁邊是否還有附帶的過路神經，如果沒有就會安全。

如果是單純終絲增粗或者簡單的脊髓栓系手術，則相對安全。對於比較複雜的脊髓栓系手術，比如合併腫瘤，或者是進行很多次的粘連，此時切除腫瘤就會帶來很大的問題，比如腫瘤難切或者是感染。因為骶尾部的栓系鬆解之後此處硬膜非常薄，尤其是兒童，所以傷口會經常不太容易癒合，比如兒童趴著睡覺，傷口經常容易出現反覆往外滲液的問題。