吸入性肺膿腫主要的致病菌是厭炎菌，主要的特徵是痰中有臭味，同時也可以合併革蘭氏陰性桿菌，革蘭氏陽性球菌的感染。如果患者確診為肺膿腫後，首選抗生素的治療，抗生素要覆蓋厭氧菌，例如青黴素、甲硝唑、奧硝唑、克林黴素、林可黴素等等，同時可完善痰培養的檢查，根據藥敏結果試驗更換抗生素。

除使用抗生素治療以外，還要注意痰液的引流，包括體位引流和使用祛痰藥物，例如氨溴索、桉檸蒎、乙酰半胱氨酸等等，必要時可以考慮介入或者是手術的治療方法。同時建議多吃青菜和水果，提高患者的機體免疫力，促進疾病的恢復。