高密度脂蛋白膽固醇屬於血脂的一種，是可以用來抗動脈粥樣硬化的脂蛋白，作用是將血液中的膽固醇從肝外轉移到肝內進行代謝。所以高密度脂蛋白膽固醇是一種好的血脂，對心血管有益。它通常與心血管風險呈負相關，即高密度脂蛋白越高，患心臟病的風險相對越小。

臨床上經常碰到患者高密度脂蛋白降低，而低密度脂蛋白高。高密度脂蛋白有利，低密度脂蛋白有害，所以在臨床上，對於低密度脂蛋白高的患者需進行治療，一般抗血脂治療藥物是他汀類藥物。