竇性心動過速的治療藥物，主要是β受體阻滯劑，在臨床上引起竇性心動過速的原因很多，所以治療應分清具體發病原因，去除原因是根本治療。如果是由於貧血造成的竇性心動過速，治療上應該糾正貧血，補充營養、補鐵、補葉酸等，心跳也會隨之恢復正常。這種情況下單純使用控制心率的藥物，並不能使病情得到很好的控制。

甲狀腺功能亢進也可以引起竇性心動過速，而且心跳相對較快，如果明確由於甲亢引起，應該針對甲亢進行藥物治療，同時應用β受體阻滯劑。原因不明的竇性心動過速患者，可以選擇β受體阻滯劑治療，臨床上目前多用β1受體阻滯劑，包括美託洛爾、比索洛爾等藥物。在臨床上除β受體阻滯劑之外，還有一種藥物也是針對竇性心動過快，叫伊伐佈雷定。