區分原發性甲狀腺功能亢進的和橋本氏甲亢，最關鍵的有兩項檢查，一項是促甲狀腺受體抗體以及甲狀腺球蛋白抗體、甲狀腺過氧化物酶抗體，另一項是彩超檢查。

原發性甲狀腺功能亢進，患者的促甲狀腺抗體水平明顯升高，甲狀腺球蛋白抗體和過氧化物酶抗體的水平基本正常或者偏高，進行彩超檢查時會提示甲狀腺的血流量明顯豐富、甲狀腺體積增大。橋本氏甲亢表現為促甲狀腺受體抗體水平正常，而甲狀腺球蛋白抗體和過氧化物酶抗體則明顯升高。

另外，行甲狀腺彩超檢查時會發現甲狀腺體積有輕度增大，甲狀腺回聲粗糙、回聲不均勻。通過以上兩種檢查，可以把兩個疾病區分開來。