嬰兒出現甲減時，複查的時間主要與病程相關。治療的初期，需要密切的檢查甲狀腺功能才能調節藥物的用量，所以一般每2週一次。調節藥物用量後，維持血清的促甲狀腺激素和甲狀腺激素正常後，每三個月複查一次。甲狀腺功能恢復正常後，1-2年後應該每6個月複查一次。

如果患兒出現明顯的不適，或者症狀明顯加重時，需要及時的複查甲狀腺功能，沒有時間上的規律。