病毒性心肌炎常用的檢查包括血液系統檢查、心電檢查、超聲檢查、核醫學同位素檢查。在血液檢查中可發現某些病毒抗原比值升高、補體改變、血沉增快、心肌酶升高、電解質改變等。心電方面檢查中，心電圖屬於最常用檢查方法，可發現各種類型的心律失常。影像檢查時超聲可發現心腔擴大；心肌核素可以看到心肌損害斑點狀、點片狀改變等。