三叉神經痛的診斷主要依靠典型臨床表現，體格檢查方面一般沒有特殊表現。在發病早期，如果疼痛間歇即不疼時，體格檢查沒有變化，跟正常人沒有區別。有些患者表現為面部感覺過敏，或輕微撫摸面部、頭皮或頭髮，即可以誘發面部疼痛，因三叉神經痛受血管壓迫刺激，神經處於高敏狀態或激惹狀態，幾年後有些患者便表現為面部感覺減退，角膜反射也減退，面部皮膚比較粗糙，因三叉神經受血管壓迫，導致神經功能減弱。

原發性三叉神經痛面部一般都有扳機點，即觸發點，位於上唇或鼻翼、齒齦、口角位置，體格檢查時輕微刺激扳機點便可以誘發疼痛，因此患者幾天甚至幾個月不洗臉或只洗半邊臉。通過體格檢查誘發疼痛，有助於三叉神經痛的診斷。輔助檢查包括CT和磁共振，可以明確是繼發性三叉神經痛，還是原發性三叉神經痛，一般繼發性，如腫瘤壓迫，需要手術切除腫瘤，如果沒有腫瘤壓迫，可以做特殊的磁共振掃描，多數患者可以見到三叉神經有血管壓迫，從而指導減壓手術治療，總之三叉神經痛的體格檢查方面，陽性體徵或有意義的體徵並不是很多。