三叉神經痛的病因主要分為原發性和繼發性，往往破壞單側半月神經節，不管是顱內腫瘤或者微血管受壓，雙側三叉神經疼非常少見，一般是單側刺激，包括血管壓迫單側三叉神經，從而造成單側的三叉神經支配區域出現針刺、刀割、火燒樣疼痛。一般來說，雙側三叉神經痛的患者非常少見，只有幾萬分之一。

一般的三叉神經痛以單側，出現針刺、刀割樣疼痛，包括刷牙、進食、風吹的時候，都有可能出現疼痛，甚至出現單側面部的麻木，特別是在下頜角位置，第二支和第三支在臨床工作中最常見。還有一部分三叉神經痛患者，有可能是皰疹引起，如耳內也可能長皰疹，引起單側三叉神經痛。