月經前出現偏頭痛，考慮原因與月經前後的雌二醇水平變化有關。主要會因為月經前後，雌二醇的血清濃度下降，引起顱內血管對5-羥色胺神經遞質的敏感度相對較高，引起顱內血管張力的改變。較多年輕女孩在月經前可能出現偏頭痛，隨著年齡的增長，到絕經期時偏頭痛可能緩解。

偏頭痛本身是屬於血管性頭痛，通常顱內血管收縮，顱外血管擴張。而影響偏頭痛的因素相對較多，內分泌的因素是較為常見的一種。另外偏頭痛還有一定的家族遺傳傾向，還和精神緊張、疲勞、光線刺激，或者伴隨焦慮、抑鬱情緒有關。