引起咽喉痛伴頭痛的原因主要有以下幾種：

1、急性原因：最常見的是上呼吸道病毒性感染即感冒，可能伴有急性咽炎、急性鼻炎、急性鼻竇炎的發作。急性咽炎可表現為咽喉部疼痛、乾燥等不適，而急性鼻炎和鼻竇炎，均可影響鼻腔通氣，從而引起缺氧性頭痛。甚至急性鼻竇炎產生的分泌物，可以直接刺激中樞黏膜，引起神經反射而導致頭痛；

2、慢性原因：如長期慢性鼻竇炎，可引起長期、慢性的頭痛。尤其是鼻後滴漏綜合徵的患者，膿性分泌物倒流入咽喉部，也可引起咽喉部疼痛。

咽喉痛伴有頭痛常見於感冒，也可以由鼻部疾患引發，同時引發下游的咽喉痛，所以出現此類症狀應及時到耳鼻喉科就診。