對於不同類型的腦炎，存在不同類型的推薦用藥，需辨證論治，常見的腦炎類型及特效藥如下：

1、病毒性腦炎：特效藥是抗病毒藥物，如阿昔洛韋、更昔洛韋、噴昔洛韋、膦鉀酸鈉等，以及免疫調理類藥物，如糖皮質激素、免疫球蛋白等；

2、化膿性腦膜炎：特效藥物是敏感性抗生素，若存在金黃色葡萄球菌感染，可以使用萬古黴素、利奈唑胺。若屬於革蘭氏陰性桿菌感染，通常會選用滲透血-腦屏障較好的抗生素，如頭孢曲松、美羅培南等；

3、結核型腦炎：特效藥是抗結核類藥物，如異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇以及新型抗結核藥物；

4、真菌性腦炎：患者需應用抗真菌類藥物，如兩性黴素B、氟康唑、伏立康唑等進行治療；

5、寄生蟲腦炎：患者需使用驅蟲藥物，如吡喹酮、阿苯達唑進行治療；

6、自身免疫性腦炎：患者可應用免疫調理類藥物治療，推薦大劑量使用糖皮質激素加血漿置換，或免疫球蛋白進行治療。

除上述特異性治療，部分腦炎患者還會伴發頭痛、顱內壓增高以及癲癇症狀，還需使用對症支持藥物，如抗癲癇藥物、脫水降低顱內壓力的藥物、營養神經藥物以及改善水電解質平衡的藥物。綜合調治、對症下藥，腦炎症狀才會有所好轉。