腦炎是由於孩子感染不同的病原體，導致的腦部實質性損害，早期經過積極的治療，大部分的孩子可以痊癒，但對於重症的孩子，由於損傷部位不同、程度較嚴重，可能會遺留不同程度的後遺症，在孩子生命體徵穩定後，需要進行早期、積極的康復治療。

進行康復治療前，首先要對孩子進行全面的評估，瞭解孩子功能障礙的部位、性質、程度，從而做出正確的決策。常用的方法有運動療法，可以改善孩子肢體的功能、運動平衡協調能力；作業療法，可以改善孩子的手功能，日常作業能力；認知方面的訓練，可以改善孩子的理解，提高語言功能；同時還有行為干預及併發症的治療，如應用抗癲癇藥物。