重症腦炎臨床症狀比較重，最重的可能就是患者出現深昏迷。深昏迷的情況下，患者的生命體徵多不平穩，可能會出現心跳過快或者是過慢、血氧下降、血壓比較低，或者因為顱壓升高之後出現難以用藥物控制的高血壓。另外，患者的意識狀態很差，出現各種反射消失，如瞳孔對光反射消失、四肢腱反射消失，甚至病理性的反射都引不出，就是比較危急的情況。其次，重症腦炎可能會有癲癇持續狀態，就是難以控制的癲癇，形成惡性循環。因為腦炎之後而出現頑固的癲癇，癲癇的持續放電又加重腦組織的水腫，腦電監測可以看到大量的棘波、尖波以及異常的放電。

重症腦炎還可能是腦子的瀰漫性水腫引起了腦疝，最常見的是顳葉鉤回疝以及枕骨大孔疝。枕骨大孔疝的時候可能會引起呼吸循環的中樞受累，從而出現呼吸頻率、血氧的極大波動、心跳減慢以及腦心綜合徵等。腦心綜合徵就是腦子得了比較重的疾病之後會出現心臟功能的受損，比如心肌缺血、心臟功能衰竭等，以上就是重症腦炎比較常見的表現。另外，重症腦炎還有常見的併發症，比如長期臥床可能出現吸入性肺炎、褥瘡、下肢深靜脈血栓等併發症，也是重症腦炎患者死亡常見原因。